睿聯(lián)實時渲染虛擬仿真小型機應(yīng)用之五：活體細胞動力分析系統(tǒng)

    睿聯(lián)實時渲染虛擬仿真小型機應(yīng)用之五：活體細胞動力分析系統(tǒng)

    目前，大部分細胞檢測方法采用的仍是傳統(tǒng)的終點法——僅僅是給實驗定格了一個最終結(jié)果，而且經(jīng)常需要標記和破壞細胞。這就是當前細胞分析方法的最大限制，因為細胞是活體，其生物學和細胞進程是動態(tài)而非靜態(tài)的。因此，為了更充分的了解和測量生物學和細胞進程，應(yīng)當使用一種非侵入性的系統(tǒng)，來記錄細胞應(yīng)答某些刺激(如藥物處理或某種生長因子刺激)時所產(chǎn)生的動態(tài)變化。

    目前，國外研究進行活體細胞動力分析已進入納米級，納米級分子動力學（NAMD）以及視覺分子動力學（VMD）都是功能強大且應(yīng)用廣泛的工具軟件，它們被用于生物分子過程的模擬和可視化。但是，模擬復(fù)雜的分子系統(tǒng)是一件耗時的工作，而且還需要使用巨大、復(fù)雜的計算機群集才能完成。   

    睿聯(lián)嘉業(yè)Plex D2型實時渲染虛擬仿真小型機在離子模擬方面的速度了比18顆CPU的群集高出了100多倍（以CPU總時間對比GPU總時間為基礎(chǔ)計算得出）。該機采用NVIDIA 最新Quadro® Plex 可視化處理系統(tǒng)（VCS），實現(xiàn)了虛擬仿真實時渲染可視化運算密度的巨大飛躍，帶來突破性的處理效率和處理能力。采用一臺三顆GPU的工作站時，類似的視覺分子動力學工具中的時均化靜電運算達到了705 Gigaflops的浮點性能。這種超高的性能讓所有生物學研究人員的工作站均能夠達到等同于計算群集的計算能力。   

    有了GPU計算，分子模擬就不再受到群集的服務(wù)器空間限制了。通過在個人實驗室的工作站以及臺式機上運行模擬，項目不再因計算資源稀缺而互相爭搶。與從前只能排隊等待處理相反，研究人員在需要時可及時獲得運算結(jié)果。而且，大型服務(wù)器群集擁有了GPU之后，更復(fù)雜的難題就能夠得以解決。而這種計算能力在以前還只是一個夢想。

    利用全國最快的超級計算機來解讀活體細胞的最小組件，正在加速藥品研究以及解釋生物進程中其它至關(guān)重要的研究步伐。

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